原创《海稻86籼粳性鉴定》：关于免费籼论文范文在这里免费下载与阅读,为您的籼相关论文写作提供资料。
摘 要：海稻86是非常珍贵的耐盐碱水稻种质资源,其耐盐碱优良性状为有效利用黄河三角洲盐碱地、增加粮食产量提供了可能.本研究利用InDel分子指数法对海稻86的籼粳性进行分析,结果表明海稻86为籼稻,且初步确定其不是野生稻.这就为杂交育种亲本配组中有效利用海稻86耐盐碱优良性状提供了参考.
关键词：海稻86；InDel标记；籼粳性
中图分类号：S511.035.1文献标识号：A文章编号：1001-4942（2016）10-0024-03
海稻86是以1986年陈日胜在湛江海边发现的海水稻而命名,2014年9月1日该品种正式在农业部《农业植物新品种保护公报》上公布.海稻86的典型特点是稻穗为青白色,具有较强的耐盐碱、耐淹能力,是非常珍贵的水稻种质资源.水稻是改良盐碱地的先锋作物[1,2],可有效压盐洗碱,改良土壤,使重度盐碱地改良为中、轻度盐碱地.山东省黄河三角洲地区目前有近46.7万公顷盐碱地,不适合耐盐碱性差的作物生长[3].有效的解决方案之一是育种家将优良水稻品种和海稻86杂交选育出适合黄河三角洲地区种植的耐盐碱水稻品种.然而,目前对于海稻86的籼粳性尚未定论.如果在杂交育种亲本配组之前不能正确地了解亲本的籼粳性,则会导致选配亲本失当及育种结果不理想[4].因此,明确海稻86的籼粳属性、了解其籼粳分化程度是利用海稻86耐盐碱优良性状需要面对的首要问题.
长期以来,农业生产上用于鉴定水稻品种籼粳性的主要方法是程侃声[5]提出的“程氏指数法”,但该方法需采用较多的数量性状,需培育至成熟植株才能完成各个形态指标的测量[6],在实际分类操作过程中容易受到环境和人为主观因素影响[7].针对传统鉴定方法存在的缺陷,卢宝荣等[8]通过比对粳稻品种日本晴和籼稻品种93-11基因组序列,筛选并实验验证出和栽培稻的籼粳遗传分化密切相关的34个InDel特异位点,可以快速、准确地鉴定水稻品种的籼粳性及籼粳分化程度,并将该方法称为“InDel分子指数法”.InDel分子指数法是鉴定水稻籼粳属性的特异方法,相对于传统鉴定方法具有更高的可操作性和灵敏性,可以用于籼粳属性鉴定及遗传分化等方面的研究 [6, 9,10].本研究采用InDel分子指数法对海稻86的籼粳性进行分析鉴定,以期为合理利用海稻86进行杂交育种提供依据.
1材料和方法
1.1材料
用于本研究的材料为粳稻品种日本晴、籼稻品种93-11以及待测品种海稻86.
1.2DNA提取
将日本晴、93～11以及海稻86种植在28℃人工气候箱中生长至3～4叶期, 每个品种选择新鲜叶片约1 g ,按照CTAB方法提取各水稻品种基因组DNA[11].
1. CR扩增及电泳检测
采用赛默飞世尔科技（中国）有限公司合成的34对特异性InDel引物（表1）对日本晴、93-11以及海稻86基因组DNA进行PCR扩增.扩增体系：2×Taq Mix 5 μL,上、下游引物各0.5 μL（引物浓度10 μmol/L）,1 μL 模板DNA（50 ng）,ddH2O补足至10 μL.反应程序：95℃预变性5 min；95℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环；72℃延伸10 min.PCR扩增产物用3%琼脂糖凝胶电泳检测,电压100 V,电泳时间60 min左右.
1.4数据分析
InDel分子标记为共显性标记,以粳稻品种日本晴、籼稻品种93-11基因组DNA电泳结果为参照,读取待测品种海稻86在34对InDel标记上的基因型数据.分析方法参考卢宝荣等[8]提出的标准进行,具体如下：在各标记位点上,凡是和日本晴扩增条带位置一致的记为纯合粳稻基因型（ ）；凡是和籼稻 93-11扩增条带位置一致的,记为纯合籼稻基因型（II）；既出现和日本晴条带位置相同又同时出现和93-11条带位置相同条带的, 则记为籼-粳稻杂合基因型（IJ）.根据海稻86在34个InDel位点（N）上的基因型数据（ 、II和IJ）来确定其籼粳类型.海稻86的籼或粳型平均基因频率（Fi或Fj）按照卢宝荣等[8]的方法,用以下公式计算：
籼稻型基因频率 Fi等于2∑N1Xii+∑N1Xij2N；
粳稻型基因频率 Fj等于2∑N1Xjj+∑N1Xij2N
式中：Xii为样品在某一InDel位点上由电泳条带判读的纯合籼稻基因型（II）；Xjj为样品在某一InDel位点上由电泳条带判读的纯合粳稻基因型（ ）；Xij为样品在某一InDel位点上由电泳条带判读的籼-粳稻杂合基因型（IJ）；N等于特异InDel引物对数34.鉴定籼粳性的判别标准见表2.
2结果和分析
2.1三个品种PCR扩增结果
用34对InDel引物对日本晴、93-11以及海稻86基因组DNA进行PCR扩增,发现在各InDel标记上产生了明显的多态性条带.其中海稻86在标记R3M53、R4M13、R4M17、R10M17上的扩增条带和粳稻品种日本晴扩增条带位置一致,在其它30个标记上的扩增条带和籼稻品种93-11扩增条带位置一致.在这34个InDel标记扩增中都未见到稻杂合基因型条带.部分标记扩增结果如图1.
2.2海稻86籼粳性分析
根据海稻86在34个InDel位点PCR扩增结果,计算其粳型（Fj）或籼型（Fi）基因频率.结果表明待测品种海稻86的粳型（Fj）基因频率为0.1176,对应的籼型（Fi）基因频率为0.8824.根据表2的籼粳性分类标准可以确定海稻86为籼稻.卢宝荣等[8]研究结果表明野生稻在R1M47等某些InDel位点扩增中会出现更高的多态性且其检测的所有野生稻均为籼、粳中性,据此可以初步确定海稻86不是野生稻.
籼论文参考资料：
结论：海稻86籼粳性鉴定为关于籼方面的论文题目、论文提纲、粳米和籼米的区别论文开题报告、文献综述、参考文献的相关大学硕士和本科毕业论文。
